L'accumulation des protons H+ dans l'espace intra-thylakoïdien entraîne un déséquilibre avec la concentration de protons extérieur ( = le stroma, pour ceux que ça intéresse...). Pour conserver l'équilibre, ces protons sortent par le seul passage possible : les sphères pédonculées, des molécules en forme de canal qui traversent la membrane du thylakoïde. Lors du passage de trois protons, la sphère pédonculée favorise une réaction biochimique capitale: un groupement phosphate est ajouté à de l'ADP (Adénosine diphosphate), créant ainsi de l'ATP (Adénosine triphosphate). Or cet ATP est une molécule essentielle à la vie car elle libère beaucoup d'énergie lors de sa consommation.

La phase claire de la photosynthèse permet donc la transformation d'energie lumineuse (les photons des rayons du Soleil) en énergie chimique (ATP et NADPH).
En résumé, voilà ce qu'il se passe dans le thylakoïde du chloroplaste:

  • A: Membrane du thylakoïde
  • B: Espace intra-thylakoïde
  • C: Strome
  • D: vésicule pédonculée
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A suivre: la phase obscure